Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCN11AQ9UI33 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms