Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fscn3Q9QXW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms