Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHCHD3Q9NX63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHCHD3Q9NX63 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms