Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PnkpQ9JLV6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PnkpQ9JLV6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms