Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col5a3Q9JLI2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Col5a3Q9JLI2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col5a3Q9JLI2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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