Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Extl1Q9JKV7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Extl1Q9JKV7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms