Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Swt1Q9DBQ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Swt1Q9DBQ9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms