Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znhit3Q9CQK1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znhit3Q9CQK1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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