Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mid1ip1Q9CQ20 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mid1ip1Q9CQ20 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms