Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Rnf17Q99MV7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf17Q99MV7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf17Q99MV7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rnf17Q99MV7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms