Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtpbp4Q99ME9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtpbp4Q99ME9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms