Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2E2Q96LR5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2E2Q96LR5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 364.3 ms