Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STAMBPL1Q96FJ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms