Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Rnf144aQ925F3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf144aQ925F3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf144aQ925F3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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