Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rassf9Q8K342 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rassf9Q8K342 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms