Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdcl3Q8BVF2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcl3Q8BVF2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms