Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med16Q6PGF3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med16Q6PGF3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med16Q6PGF3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms