Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg9aQ68FE2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg9aQ68FE2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms