Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptpn13Q64512 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptpn13Q64512 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms