Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CARD17Q5XLA6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CARD17Q5XLA6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms