Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
5730522E02RikQ5SP45 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
5730522E02RikQ5SP45 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms