Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SfswapQ3USH5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SfswapQ3USH5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms