Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rmdn3Q3UJU9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rmdn3Q3UJU9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms