Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brf2Q3UAW9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brf2Q3UAW9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms