Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ulk3Q3U3Q1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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