Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 RPL22AYLR061W 366 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RAD14YMR201C 1116 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RIB5YBR256C 717 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 PMS1YNL082W 2622 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YGR117CYGR117C 1431 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RRP5YMR229C 5190 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 KRI1YNL308C 1776 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SSM4YIL030C 3960 nt3.25□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 PEX1YKL197C 3132 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 AUS1YOR011W 4185 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 ISM1YPL040C 3009 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YCR007CYCR007C 720 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YDR282CYDR282C 1245 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 WBP1YEL002C 1293 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SPT4YGR063C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YHL026CYHL026C 948 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 BCD1YHR040W 1101 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 MCM16YPR046W 546 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 OPY1YBR129C 987 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 BYE1YKL005C 1785 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 FLO9YAL063C 3969 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SEA4YBL104C 3117 nt3.24□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SAS4YDR181C 1446 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 HDA2YDR295C 2025 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 CUE3YGL110C 1875 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SMC3YJL074C 3693 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 TPM1YNL079C 600 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 LDS2YOL047C 1071 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 SUI3YPL237W 858 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 BMT2YBR141C 1014 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 KAP95YLR347C 2586 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 THR4YCR053W 1545 nt3.23□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 AGA1YNR044W 2178 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 TMA108YIL137C 2841 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 COP1YDL145C 3606 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RAD2YGR258C 3096 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 GRX6YDL010W 696 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YIR040CYIR040C 333 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 GIS2YNL255C 462 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 RPC34YNR003C 954 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 NDJ1YOL104C 1059 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 CPA2YJR109C 3357 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 ETP1YHL010C 1758 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 STU2YLR045C 2667 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 MIC60YKR016W 1623 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 YPR022CYPR022C 3402 nt3.22□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 MTH1YDR277C 1302 nt3.21□□□□□ -1.89
SNF8Q12483 VTC4YJL012C 2166 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 MGT1YDL200C 567 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 TOS8YGL096W 831 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YET2YMR040W 483 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 IMP1YMR150C 573 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YNL320WYNL320W 855 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 VAM10YOR068C 345 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 FES1YBR101C 873 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 DSN1YIR010W 1731 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 MTR4YJL050W 3222 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YEL025CYEL025C 3567 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 DSL1YNL258C 2265 nt3.21□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 RPN2YIL075C 2838 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 ERG9YHR190W 1335 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 SET1YHR119W 3243 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 GPI13YLL031C 3054 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 snR57snR57 88 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 BET1YIL004C 429 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 ERP1YAR002C-A 660 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YAR070CYAR070C 300 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 INN1YNL152W 1230 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YOR338WYOR338W 1092 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 CTK1YKL139W 1587 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 RAD7YJR052W 1698 nt3.2□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 CLB5YPR120C 1308 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YFL040WYFL040W 1623 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 TPD3YAL016W 1908 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 MIT1YEL007W 2001 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 SPO16YHR153C 597 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 SOD1YJR104C 465 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 ECM4YKR076W 1113 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 HMT1YBR034C 1047 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 TAF14YPL129W 735 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YBR242WYBR242W 717 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 MEF1YLR069C 2286 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YMR018WYMR018W 1545 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 HMS1YOR032C 1305 nt3.19□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 ARG5,6YER069W 2592 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 RAD5YLR032W 3510 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 GCN1YGL195W 8019 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 GWT1YJL091C 1473 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YIG1YPL201C 1386 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 HIM1YDR317W 1245 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YGL152CYGL152C 678 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 YIL089WYIL089W 618 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 RPS21AYKR057W 264 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 GOT1YMR292W 417 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 IZH2YOL002C 954 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 TMA16YOR252W 537 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 MSR1YHR091C 1932 nt3.18□□□□□ -1.9
SNF8Q12483 SNT1YCR033W 3681 nt3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 155.9 ms