Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf9Q07105 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gdf9Q07105 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf9Q07105 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms