Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha4Q03137 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms