Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pou2f2Q00196 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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Pou2f2Q00196 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Pou2f2Q00196 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pou2f2Q00196 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pou2f2Q00196 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pou2f2Q00196 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Pou2f2Q00196 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou2f2Q00196 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou2f2Q00196 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms