Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Xrn1P97789 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Xrn1P97789 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Xrn1P97789 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms