Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
rp9P97762 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
rp9P97762 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
rp9P97762 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
rp9P97762 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
rp9P97762 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
rp9P97762 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
rp9P97762 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
rp9P97762 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
rp9P97762 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
rp9P97762 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
rp9P97762 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
rp9P97762 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
rp9P97762 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
rp9P97762 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms