Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1bP97358 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1bP97358 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1bP97358 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1bP97358 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1bP97358 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1bP97358 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1bP97358 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1bP97358 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1bP97358 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1bP97358 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1bP97358 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1bP97358 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1bP97358 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1bP97358 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1bP97358 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1bP97358 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1bP97358 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms