Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTP1P59025 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTP1P59025 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTP1P59025 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP1P59025 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP1P59025 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP1P59025 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP1P59025 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTP1P59025 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP1P59025 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP1P59025 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP1P59025 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTP1P59025 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTP1P59025 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTP1P59025 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTP1P59025 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms