Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fgd1P52734 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fgd1P52734 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms