Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCR3P49682 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CXCR3P49682 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms