Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nedd4P46935 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nedd4P46935 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms