Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa10P31310 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa10P31310 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms