Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC5P28715 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC5P28715 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms