Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXD10P28358 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD10P28358 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms