Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 CARM1-209ENST00000590699 2240 ntTSL 532.01■■■□□ 2.713e-10■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.243e-10■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.723e-10■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 CARM1-205ENST00000586508 1050 ntTSL 218.61■□□□□ 0.573e-10■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.523e-10■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ADGRG6-211ENST00000538281 591 ntTSL 33.17□□□□□ -1.91e-23■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ADGRG6-212ENST00000540208 652 ntTSL 32.49□□□□□ -2.011e-23■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 KIAA0907-203ENST00000368321 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 KIAA0907-202ENST00000368320 4499 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ANKZF1-211ENST00000463792 3245 ntTSL 217.32■□□□□ 0.363e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ANKZF1-218ENST00000477479 2940 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-206ENST00000430636 397 ntTSL 423.51■■□□□ 1.357e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-209ENST00000452060 588 ntTSL 221.7■■□□□ 1.067e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-202ENST00000418588 731 ntTSL 321.7■■□□□ 1.067e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-203ENST00000419218 562 ntTSL 221.7■■□□□ 1.067e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-211ENST00000461492 580 ntTSL 321.48■■□□□ 1.037e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.867e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-213ENST00000466701 364 ntTSL 420.29■□□□□ 0.847e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.817e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-210ENST00000452317 547 ntTSL 419.85■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.767e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.737e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-205ENST00000428779 841 ntTSL 319.54■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-208ENST00000435508 624 ntTSL 319.54■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-204ENST00000421560 579 ntTSL 417.87■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-217ENST00000496474 539 ntTSL 417.87■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-212ENST00000461987 372 ntTSL 317.6■□□□□ 0.417e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-207ENST00000431960 549 ntTSL 414.06□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 DAG1-214ENST00000469139 561 ntTSL 412.12□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 SMAD2-211ENST00000589877 527 ntTSL 318.51■□□□□ 0.557e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 SMAD2-204ENST00000585978 663 ntTSL 315.69■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 PDCD11-206ENST00000493610 732 ntTSL 515.36■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ABCE1-207ENST00000507193 2146 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ABCE1-206ENST00000506506 421 ntTSL 310.56□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ABCE1-203ENST00000502803 782 ntTSL 59.79□□□□□ -0.846e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 54.39□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 PELP1-205ENST00000570823 484 ntTSL 425.51■■□□□ 1.674e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 PELP1-207ENST00000571347 708 ntTSL 223.07■■□□□ 1.284e-8■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 AC114490.2-201ENST00000487874 3099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 ZMYM6-209ENST00000493328 6241 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 KBTBD2-204ENST00000452926 537 ntTSL 415.92■□□□□ 0.141e-20■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 KBTBD2-203ENST00000424468 593 ntTSL 48.73□□□□□ -1.011e-20■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 KBTBD2-202ENST00000423022 556 ntTSL 36.63□□□□□ -1.351e-20■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 KBTBD2-205ENST00000453627 724 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-20■■■■■ 28.3
U2AF2P26368 RPL23-205ENST00000470646 333 ntTSL 314.9□□□□□ -0.023e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-202ENST00000378096 392 ntTSL 313.69□□□□□ -0.223e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-203ENST00000394332 625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.223e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-207ENST00000577407 615 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.223e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-208ENST00000577760 3081 nt13.13□□□□□ -0.313e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-204ENST00000394333 444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-209ENST00000584056 549 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-206ENST00000479035 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.543e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-201ENST00000245857 588 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.543e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL23-211ENST00000584912 2779 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.623e-23■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 CDC27-218ENST00000575830 397 ntTSL 51.31□□□□□ -2.22e-6■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 IFI35-201ENST00000246911 747 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 IFI35-208ENST00000546325 525 ntTSL 513.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 MPHOSPH9-201ENST00000302373 3097 ntTSL 1 (best)4.06□□□□□ -1.761e-7■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 MPHOSPH9-217ENST00000545556 3634 ntTSL 53.42□□□□□ -1.861e-7■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 CEP78-211ENST00000536374 2975 ntTSL 221.09■□□□□ 0.972e-11■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.166e-8■■■■■ 28.2
U2AF2P26368 UBE2Q2P1-201ENST00000339094 2150 ntTSL 224.06■■□□□ 1.442e-17■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC2.64□□□□□ -1.992e-17■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 POLR3A-202ENST00000472014 699 ntTSL 314□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 GART-212ENST00000466882 654 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-16■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.668e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 56.14□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 54.19□□□□□ -1.743e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 EEA1-202ENST00000418984 2542 ntTSL 520.32■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.648e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 METAP1-211ENST00000514051 1058 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 METAP1-207ENST00000510133 715 ntTSL 58.07□□□□□ -1.122e-9■■■■■ 28.1
U2AF2P26368 AL157392.3-203ENST00000615691 921 ntTSL 520.59■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-213ENST00000622389 853 ntTSL 517.66■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-205ENST00000617260 931 ntTSL 517.29■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-210ENST00000613467 780 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-202ENST00000597920 1446 ntTSL 515.2■□□□□ 0.021e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-209ENST00000596499 712 ntTSL 512.66□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-212ENST00000616949 811 ntTSL 512□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.5-201ENST00000601460 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 AL157392.3-208ENST00000599639 652 ntTSL 56□□□□□ -1.451e-8■■■■■ 28
U2AF2P26368 TAPT1-206ENST00000505317 1376 ntTSL 228.05■■■□□ 2.083e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 TAPT1-213ENST00000511156 483 ntTSL 320.05■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 28
U2AF2P26368 TAPT1-211ENST00000508888 837 ntTSL 315.04■□□□□ -08e-8■■■■■ 28
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 465.6 ms