Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18525 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18525 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18525 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18525 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18525 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18525 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18525 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P18525 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18525 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18525 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18525 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18525 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18525 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18525 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18525 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18525 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms