Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FlgP11088 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FlgP11088 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FlgP11088 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FlgP11088 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FlgP11088 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FlgP11088 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FlgP11088 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FlgP11088 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FlgP11088 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FlgP11088 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FlgP11088 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FlgP11088 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FlgP11088 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FlgP11088 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FlgP11088 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FlgP11088 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FlgP11088 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms