Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJB6O95452 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJB6O95452 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJB6O95452 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJB6O95452 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJB6O95452 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJB6O95452 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms