Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vamp4O70480 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vamp4O70480 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp4O70480 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms