Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpd52l1O54818 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tpd52l1O54818 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms