Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4884E9PVP9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm4884E9PVP9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms