Protein–RNA interactions for Protein: C9J798

RASA4B, Ras GTPase-activating protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4BC9J798 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RASA4BC9J798 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASA4BC9J798 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms