Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprbB2RU80 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.4 ms