Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp42B2RQC2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp42B2RQC2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp42B2RQC2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms