Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01549A6NIU2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms